Entre cantos e recantos, há um outro encanto em Florianópolis, suas pequenas ilhas. Com características bem distintas, algumas ilhas destacam-se por suas riquezas naturais. Outras, por preservarem um pouco da história da ocupação humana na região.
Um arquipélago com muitas ilhas.
As ilhas mais importantes para visitação são a de Raton Grande e Anhatomirim, na Baía Norte e a Ilha do Campeche, um paraíso de águas cristalinas e areias brancas, localizada na parte Sudeste, em frente a praia com o mesmo nome.
No lado Norte, voltado para o canal que separa a Ilha de Santa Catarina do continente, estão as Ilhas de Anhatomirim e as Ratones (Raton Grande e Raton Pequena), partes importantes do conjunto de fortalezas militares que protegiam a região no período colonial. Há também pequenas ilhas, como as Ilhas dos Guarás (grande e a pequena), próximas a baía norte.
No extremo Norte, em mar aberto, no limite entre os municípios de Florianópolis, Governado Celso Ramos e Bombinhas, fica a Reserva Biológica Marinha do Arvoredo. Este pequeno arquipélago é formado por três Ilhas e o Calhau de São Pedro. A Ilha da Galé é considerada um dos pontos mais importantes da costa brasileira para a procriação de fragatas e atobás. A Ilha Deserta também é refúgio de aves e a do Arvoredo é considerada uma das mais belas ilhas de Florianópolis. Essa região, por pertencer à categoria de Reserva Biológica, é fechada à visitação. Entretanto, o mergulho é permitido em área delimitada. A alta diversidade de ambientes marinhos e terrestres existentes na Reserva Biológica Marinha do Arvoredo abriga uma infinidade de espécies, sendo muitas delas raras e ameaçadas de extinção. As ilhas apresentam remanescentes de Mata Atlântica, locais de reprodução para aves marinhas e sítios arqueológicos com sambaquis e inscrições rupestres.
Já no lado Norte, voltado para o oceano, estão localizadas as ilhas do Francês, entre as praias de Jurerê e Canasvieiras, Mata Fome e Moleques do Norte na Praia dos Ingleses . Estas duas não possuem praias, apenas costões, e por isso não são procuradas para passeios. Já a do Francês é muito utilizada pelos proprietários de embarcações particulares para fundear no lado sul, abrigado da corrente oceânica. Em terra, costões de pedra, mata verde e uma pequena enseada com praia fazem parte de seu visual.
Na praia do Santinho, duas ilhas são avistadas: a do Badejo e a das Aranhas, segundo a lenda, um reduto de aracnídeos. Ambas não possuem acesso para desembarque.
Já na parte Sul de Florianópolis existem várias ilhas: No lado Sudeste, entre as praias da Armação e do Matadeiro, está a Ilha das Campanhas. Mais ao sul existe o pequeno conjunto das Moleques do Sul. Em frente as praias do Pântano do Sul, Açores, Solidão e Saquinho está o grupo das Três Irmãs (Irmã Pequena, do Meio e de Fora) e a Ilha de Araçatuba, esta última avistada a partir da praia de Naufragados. Estas ilhas pertencem aos limites do Parque Estadual da Serra do Tabuleiro e a entrada só é permitida com autorização prévia da Unidade de Gestão do Parque. Atualmente, a visitação turística nas ilhas Três Irmãs e na Ilha de Araçatuba está temporariamente suspensa. Já o acesso as Moleques do Sul é proibido por ser uma área de preservação ambiental. Ainda no lado sul, no canal entre a ilha e o continente, há pequenas ilhas inhabitadas, como as ilhas dos Cardos, do Largo, das Laranjeiras, das Vinhas e Dona Francisca. Esta última possui moradores e seu acesso, durante a maré baixa, é possivel por caminhada através do canal.
Próximo as praias na região continental existem duas ilhas. Ao norte a pequena ilha dos Noivos, em frente a praia do Balneário. Na porção sul, no bairro de Coqueiros, está a Ilha de Coqueiros.
Para conhecer as diversas ilhas de Florianópolis recomendamos contratar os passeios de escunas, com trajetos e horários definidos, e os passeios de lanchas, que permitem personalizar seu trajeto e tempo de diversão.