X-Quem? narra os acontecimentos após os recentes conflitos entre humanos e mutantes, a veterana Capitã Ruby assume o posto de líder da Aliança Pacifista ao perceber que mais uma guerra se aproxima. Em meio ao caos causado pela Liga Rebelde, sedenta pelo controle dos distritos da nação, a Capitã recruta um grupo de jovens calouros com poderes peculiares a fim de treiná-los para montar sua nova equipe. Nesta paródia musical, os heróis descobrem a doçura do primeiro amor, os desafios da primeira missão, o desespero dos primeiros socorros e a temível batalha contra o mal.